Nöbetçi Eczaneler
Okyanusu inceleyen bilim insanları için doğru verileri bulmak, bazen bu verilerle ne yapacaklarını bulmak kadar zor olabiliyor.
Deniz tabanının derinliğini, su altı dağlarının konumunu veya deniz yüzeyi sıcaklıklarını öğrenmek mi istiyorsunuz? Bilgiler mevcut, ancak bunları farklı kaynaklardan bir araya getirmek ve uygun formata getirmek önemli miktarda zaman ve bilgisayar kodlaması gerektirebilir.
UC Santa Barbara’daki bilim insanlarının da aralarında bulunduğu bir araştırma ekibi, bilim insanlarının veri temizleme yerine soruları yanıtlamaya odaklanabilmeleri için bu süreci çok daha kolay hale getirmek üzere tasarlanmış yeni bir araç geliştirdi. Oceandatr adı verilen yazılım paketi, veri analizi için yaygın olarak kullanılan bir programlama dili olan R’de geliştirildi. Kullanıcılar tek bir komutla çok çeşitli küresel okyanus veri kümelerine erişebilir, bunları düzenleyebilir ve analiz ve haritalama için hazırlayabilirler.
Ekip, yeni paketi Ecology and Evolution dergisinde yayınlanan bir makalede açıklıyor . UC Santa Barbara’nın Çevre Pazarları Laboratuvarı’nda (emLab) proje bilimcisi olan baş yazar Jason Flower’a göre, en önemli şey, coğrafi okyanus verilerine ihtiyaç duyan herkesin ihtiyaç duyduğu verilere, istediği formatta, hızlı ve kolay bir şekilde ulaşmasına yardımcı olabilmesidir.
Flower ve meslektaşları, oceandatr’ı kısmen Waitt Enstitüsü ile Vanuatu ve Fiji gibi küçük ada ülkelerinde deniz alan planlaması üzerine yaptıkları çalışmalar sayesinde geliştirdiler.
Okyanus Verilerine Erişimi Kolaylaştırmak
Okyanusun geleceğini planlamak, deniz tabanı haritaları, sıcaklık ve balıkçılık gibi insan faaliyetlerine ilişkin verilere ihtiyaç duyar. Araştırmacılar genellikle bu bilgileri birden fazla kaynaktan toplamalı ve veri kümelerini birleştirmek için yeni kodlar yazmalıdır.
Ekip, bu süreci basitleştirmek için oceandatr’ı oluşturdu. Flower ve meslektaşları, aynı kodu tekrar tekrar yazmak yerine, en sık kullandıkları programlama komut dosyalarını oceandatr’da hazır fonksiyonlara dönüştürerek süreci basitleştirdiler. R paketi, yaygın olarak kullanılan okyanus veri kümelerine erişim için kodu düzenleyerek araştırmacıların tek bir komutla verileri haritalama ve analiz için hazırlamalarına olanak tanır. GitHub’da bulunan yazılım, tüm araştırmacılar için ücretsiz olarak kullanılabilir.
“Bu makale benzersiz çünkü belirli bir araştırma sorusuna cevap aramıyorduk,” diyor emLab’da proje bilimcisi olan ortak yazar Echelle Burns. “Bizim gibi, aynı veri çekme ve düzenleme iş akışını tekrar tekrar kullanan deniz bilimcileri için bir araç geliştiriyorduk.”
Deniz Tabanı Derinliğinden Balıkçılık Faaliyetlerine
Bu paket, deniz tabanı derinliği, denizaltı dağlarının konumları ve deniz yüzeyi sıcaklığı gibi çeşitli mekansal okyanus veri kümelerini alabilir.
Araştırmacılar makalelerinde iki potansiyel uygulama örneği sunuyor. Bir örnekte, deniz verilerini deniz koruma alanlarının planlanmasına rehberlik etmek için kullanıyorlar. Diğer bir örnekte ise, balıkçılık faaliyetlerinin nerede gerçekleşme olasılığının yüksek olduğunu modellemek ve haritalamak için verileri kullanıyorlar. Bu örnekler, aracın yapabileceklerinin sadece küçük bir bölümünü temsil ediyor. Flower, “Bu paket, mekansal veri gerektiren herhangi bir deniz bilimi projesinde kullanılabilir” dedi.
Özellikle kullanışlı özelliklerden biri, farklı kaynaklardan gelen verileri standartlaştırma yeteneğidir. Araştırmacılar genellikle birden fazla veri setini birleştirmeye ihtiyaç duyarlar, ancak bu veri setleri farklı mekansal formatlarda veya ölçeklerde saklanabilir. Örneğin, oceandatr’ın çektiği batimetri verilerinin çözünürlüğü 15 yay saniyesidir (0,25 dereceden biraz daha az). Bu arada, balıkçılık faaliyeti verileri, kullanıcı tercihine bağlı olarak 0,01 derece veya 0,1 derece gibi çok daha hassastır. Oceandatr, kullanıcıların analize odaklanabilmesi için bu verileri arka planda tutarlı bir formata getirmeye yardımcı olur.
Bu araç küresel veri kümelerine erişim sağlıyor, ancak tek tek adalar veya kıyı bölgeleri de dahil olmak üzere nispeten küçük alanlarda çalışan araştırmacılar için de faydalı olabilir. Burns, “Kullanıcılar kendi veri kümelerini sağlayabilir ve oceandatr bunların uygun mekansal ölçekte kaydedilmesini sağlayacaktır” dedi.
Sürekli Gelişen Bir Araç
Araştırmacılar oceandatr’ı genişletmeye ve geliştirmeye devam etmeyi planlıyor. Gelecekteki eklemeler arasında, halihazırda mevcut olan ortalama deniz yüzeyi sıcaklığı bilgilerinin yanı sıra günlük deniz yüzeyi sıcaklığı verileri de yer alabilir. Flower ayrıca, yazılımın daha hızlı ve verimli olmasını sağlayarak, eski veya daha yavaş bilgisayarlarda çalışan araştırmacılar için erişilebilir kalmasını sağlamak için de çalışıyor.
Birçok bilimsel yazılım aracı gibi, oceandatr da tamamlanmış bir ürün olarak tasarlanmamıştır. Burns, “R paketleri sürekli gelişiyor ve oceandatr da onlarla birlikte gelişecek,” dedi. “Bu, önümüzdeki yıllarda güncellenmeye ve geliştirilmeye devam edecek ‘yaşayan bir paket’.”
Araştırmacılar, oceandatr’ın veri bulma ve hazırlama sürecindeki tekrarlayan işlerin bir kısmını ortadan kaldırarak bilim insanlarına verilerin cevaplamalarına yardımcı olabileceği sorulara odaklanmaları için daha fazla zaman kazandıracağını umuyorlar.
Kaynak: https://ecomagazine.com/news/research/new-oceandatr-tool-gives-marine-scientists-faster-access-to-ocean-data/
